دو محقق متخصص در مسائل مربوط به صداقت علمی می‌گویند که داده‌های کاتالوگ بیشتر از ۱۰۰ آنتی‌بادی فروخته شده توسط شرکت خدمات تحقیقاتی و تجهیزات آزمایشگاهی ترمو فیشر ساینتیفیک (Thermo Fisher Scientific) حاوی تصاویری است که انگار دستکاری شده‌اند.

به نقل از نیچر، محققان یافته‌های خود را به طور آنلاین در یک پایگاه داده ثبت کرده‌اند که شامل ۱۲۷ «عکس مشکل‌ساز» مرتبط با آنتی‌بادی‌های این شرکت می‌شود. مشکلات مربوط به تصاویر که برای نشان دادن کیفیت و کارکرد آنتی‌بادی‌ها در کاتالوگ گنجانده شده‌اند، از تغییرات جزئی که علتزیباتر شدن تصاویر خواهد شد تا تغییرات گسترده‌ای که صحت داده‌ها را زیر سوال می‌برند، متغیر است. این بازدید توسط ریس ریچاردسون، یک دانشمند علوم فراشناختی در دانشگاه نورث وسترن در اوانستون، ایلینوی، رهبری شد. کارآگاهان علمی، دستکاری‌های بسیاری را در تصاویر مقالات علمی انتشار شده کشف کرده‌اند، اما تازه ترین اکتشافات، اولین مجموعه از مواردی می باشند که در کاتالوگ فروشندگان یافت خواهد شد. تحول عکس لزوما به معنی نقص محصولات مهم نبوده است.

آنتی‌بادی‌ها که مولکول‌های زیستی Y شکل تخصصی می باشند، ابزاری حیاتی برای محققان علوم زیستی به شمار می‌روال که از آنها در آزمایش‌ها برای اتصال به پروتئین‌های خاص و ردیابی آنها منفعت گیری می‌کنند. اما برای دهه‌ها، دانشمندان از کیفیت و کارکرد آنتی‌بادی‌های تهیه شده از فراهم‌کنندگان تجاری شکایت داشته‌اند و آن را بحران عدم مطمعن می‌نامند. یک بازدید در سال ۲۰۲۳ بر روی ۶۱۴ آنتی‌بادی تجاری نشان داد که بیشتر از نیمی از آنها مطابق مشخصات اظهار شده عمل نمی‌کنند.

سندی پوند، مدیر ارشد ارتباطات ترمو فیشر، مستقر در والتام، ماساچوست، می‌گوید: ما این نوشته را جدی می‌گیریم و یک بازدید داخلی جامع را اغاز کرده‌ایم. از این بعد، در جایی که عکس مهم وجود ندارد یا در دسترس نیست، ما مطمعن حاصل می کنیم که کاربران وب‌سایت مطلع شوند که تصاویر آنتی‌بادی امکان پذیر برای اراعه و وضوح در وب‌سایت بهینه شده باشند.

از وقتی که کارآگاهان یافته‌های خود را به طور آنلاین انتشار کردند، برخی از محققان این سوال را نقل کرده‌اند که آیا شرکت‌ها محصولات خود را به دقت اعتبارسنجی نمی‌کنند و به این علت در بحران عدم مطمعن از آنتی‌بادی نقش دارند یا خیر. جنیفر بیرن، محقق سرطان در دانشگاه سیدنی استرالیا، می‌گوید: من نمی‌توانم جلوی این حس را بگیرم که در برخی سطوح، این نوشته به طور بالقوه نشان‌دهنده برخی کاستی‌های خود معرف‌ها است. با این حال، دیگران می‌گویند به گمان زیاد هیچ ارتباطی وجود ندارد. کارل لافلام، دانشمند ارشد برنامه «توصیف آنتی‌بادی از طریق علوم باز» که برنامه‌ای است که آنتی‌بادی‌های فروخته شده توسط فروشندگان تجاری، از جمله ترمو فیشر را آزمایش می‌کند، می‌گوید: جواب من منفی خواهد می بود. بحران عدم مطمعن از آنتی‌بادی سال‌ها است که وجود دارد و علت آن برخی تصاویر انگار تحول یافته در وب‌سایت یک شرکت نیست.

بحران عدم مطمعن

سال قبل، بازار جهانی آنتی‌بادی بیشتر از ۲۵۰ میلیارد دلار آمریکا قیمت داشت و صدها شرکت در کل بیشتر از هفت میلیون آنتی‌بادی می‌فروختند. کاتالوگ ترمو فیشر به تنهایی شامل بیشتر از ۲۵۰ هزار آنتی‌بادی اولیه است.

شرکت‌ها برای تبلیغ و اعتبارسنجی کارکرد آنتی‌بادی‌های خود، داده‌های حمایترا به کاتالوگ‌های خود اضافه می‌کنند. این داده‌ها شامل آزمایش وسترن بلات می‌شود که با منفعت گیری از روشی انجام می‌شود که در آن پروتئین‌ها در یک مخلوط تشخیص داده خواهد شد. در این روش از آنتی‌بادی‌ها برای «برچسب‌گذاری» مؤثر پروتئین‌های خاص با اتصال انتخابی به آنها منفعت گیری می‌شود. اگر یک آنتی‌بادی انچه که باید عمل کند، یک پروتئین به گفتن یک باند مجزا در آزمایش ظاهر می‌شود. اتصال ضعیف و کم‌گزینش آنتی‌بادی می‌تواند تبدیل باندهای متعدد یا لکه‌های فازی شود.

چند هفته پیش، شولتو دیوید، زیست‌شناس مولکولی متخصص در مسائل مربوط به صداقت در تحقیقات مستقر در آکسفورد، انگلستان، در حال جستجوی وسترن بلات یک پروتئین در یک رده سلولی خاص می بود که به طور اتفاقی به یک عکس شگفت در کاتالوگ ترمو فیشر برخورد کرد. دیوید می‌گوید چندین باند در آزمایش وسترن بلات، شکلی «موج‌دار» داشتند که «نزدیک» می بود. آن‌ها یکسان به نظر می‌رسیدند، اگرچه به نظر می‌رسید که وارونه یا چرخانده شده‌اند. او اضافه می‌کند که یک شکل خاص نباید به طور مکرر در وسترن بلات ظاهر شود، چون مشخص می کند که آنها به گمان زیاد کپی، جابه‌جا و جای‌گذاری شده‌اند. او اضافه می‌کند: من فقط فکر می‌کردم که به گمان زیاد این یک مورد خاص است. نظردهندگان در رسانه‌های اجتماعی عکس العمل نشان دادند و تعداد بسیاری از آن‌ها ناامیدی خود را در رابطه بحران عدم مطمعن از آنتی‌بادی ابراز کردند.

محققان فرد دیگر در عرض یک هفته، ۱۰۵ عکس انگار تغییریافته دیگر را شناسایی کردند. برخی شامل نوارهای پروتئینی تکراری بودند. عکس بعد‌عرصه بیشتر از ۲۰ مورد به طور دستی «رنگ‌آمیزی» شده می بود تا رگه‌ها یا نقص‌ها نهان شود. با این حال، قابل دقت‌ترین آنها، ۵۰ لکه جداگانه می بود که بعد‌عرصه‌های بصری یکسانی داشتند. این محقق می‌گوید که امکان ندارد که این همه عکس همه انها بعد‌عرصه یکسانی داشته باشند.

اعتبارسنجی داده‌ها

چه فردی مسئول تغییرات ظاهری است؟ اشکار نیست. لکه‌های وسترن در کاتالوگ ترمو فیشر شامل خط اعتباری برای شناسایی محققی که آنها را به وجود اورده است، نیستند. پوند می‌گوید تصاویر به طور داخلی و توسط اشخاص ثالث تشکیل خواهد شد و ترمو فیشر به گفتن بخشی از بازدید داخلی خود، منشأ تصاویر مورد نظر را بازدید می‌کند.

کارآگاهانی که با نیچر سخن بگویید کردند، می‌گویند که به نظر می‌رسد تعداد بسیاری از تغییرات در تصاویر عمدا با ابزارهایی همانند ادوبی فتوشاپ انجام شده است. ریچاردسون می‌گوید برخی جزئی می باشند و امکان پذیر فقط برای «زیباتر نشان دادن» عکس در نظر گرفته شده باشند، اما ما تا وقتی که نسخه مهم را نداشته باشیم، نمی‌توانیم یقین باشیم.

دیوید می‌گوید اگرچه تصاویر کاتالوگ تبلیغاتی می باشند و نه ارقامی در یک مقاله علمی که ادعا می‌شود یک کشف تجربی را اثبات می‌کند، اما هم چنان باید مطابق با استانداردهای علمی باشند.

برخی از تغییرات ظاهری، همانند خطوط موج‌دار تکراری که دیوید برای اولین بار برای آنتی‌بادی به نام MA5-12557 مشاهده کرد، دانشمندان را گیج کرده است. لافلام می‌گوید آن آنتی‌بادی به خوبی کار می‌کند، به این علت نیازی به جعل هیچ داده‌ای نبوده است. این بهترین آنتی‌بادی در کل کاتالوگ آنتی‌بادی‌های تجاری است.

ریچاردسون می‌گوید امیدوار است که عمومی کردن پایگاه داده تصاویر، تولیدکنندگان آنتی‌بادی را تحت سختی قرار دهد تا در اعتبارسنجی‌های خود کوشاتر باشند. با این حال، در مختصر‌زمان، تا این مدت هم ماموریت بازدید کارکرد آنتی‌بادی‌های آنها بر مسئولیت محققان است. او می‌گوید: برای این منظور، واقعا هیچ کار بهتری وجود ندارد که بتوانید انجام دهید، جز این که خودتان آنها را آزمایش کنید و خودتان آنها را اعتبارسنجی کنید.